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DocteurN
France
9591 Posts |
 Posted - 01 sept. 2005 : 11:06:14
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Folding@Home
ou Votre ordinateur au secours de la recherche sur les protéines
Présentation
L'état actuel des connaissances nous apprend que de nombreuses maladies, génétiques ou non, se traduisent par des anomalies dans la forme des protéines. L'exemple le plus célèbre étant le prion (responsable de la tremblante du mouton, des maladies de la vache folle et de Creutzfeld-Jakob).D'autres exemples de maladies impliquant une mauvaise conformation des protéines sont la maladie d'Alzheimer et de nombreux cancers.
Il est donc important, connaissant la formule chimique d'une protéine, de connaître également les différentes formes qu'elle peut prendre en se repliant, ceci pouvant déterminer son caractère "normal" ou "anormal", inoffensif ou pathogène. Ce repliement étant trop rapide pour être observé "in vivo", une équipe de recherche de l'Université de Stanford, animée par le professeur Vijay Pande, le Pande Group, a décidé d'avoir recours à la simulation informatique pour remédier à cette impossibilité. Il s'agit du projet Folding@Home. Cette simulation nécessite une énorme puissance de calcul qui représente un investissement financier hors de portée de la plupart des services de recherche universitaires.
 En se fondant sur le modèle adopté par l'Université de Berkeley pour le projet Seti@Home, Le Pande Group fait appel à la technique du calcul distribué qui consiste à "découper" en petites unités indépendantes les calculs à effectuer pour les répartir entre de très nombreux ordinateurs du type ordinateur personnel (Mac ou PC). Pour obtenir la puissance de calcul nécessaire à un avancement rapide des recherches, le Pande Group fait appel, dans le monde entier, aux possesseurs d'ordinateurs personnels, disposant d'une connexion à l'Internet, pour offrir au projet la puissance inutilisée de leurs machines. En effet, sur un plan statistique, on peut constater que près de 95% de la puissance des ordinateurs de type personnel est inemployée. En clair nos ordinateurs passent 95% de leur temps à attendre que nous leur fassions exécuter une tâche, laquelle tâche ne requiert que rarement la totalité de la puissance disponible.
Pour participer à ce projet il suffit de télécharger depuis le site de l'Université de Stanford un logiciel appelé "client" qui, une fois installé et configuré, va appeler un serveur de Folding@Home, charger une unité de travail (WU), effectuer les calculs, renvoyer les résultats au serveur, charger une nouvelle unité, et ainsi de suite, aussi longtemps que vous souhaiterez contribuer à ce projet scientifique. Ce logiciel n'interfère pas avec le fonctionnement de votre ordinateur, ni avec votre travail, il se connecte de temps en temps pour envoyer un résultat et en même temps demander du travail aux serveurs du projet à l'université de Stanford.
Des résultats scientifiques ont déjà été publiés comme vous pourrez le constater sur cette page du site officiel de F@H
La Mini-Team GpsPasSion
Les francophones participant au projet se sont regroupés dans une même équipe appelée "Alliance Francophone" (numéro 51) elle-même scindée en plusieurs groupes : les mini-teams.
C'est justement une de ces mini-teams que je vous propose de créer. Pour cela il suffit de suivre le tutoriel d'installation/Configuration ci-dessous et par la suite vous pourrez suivre les résultats > ICI <
Installation et Configuration
- Télécharger la dernière version de Folding@Home version console. (Windows 95/98/ME/NT/2000/XP "No-nonsense" text-only console)
Il est conseillé d'utiliser la version console et non pas graphique car la console est beaucoup plus configurable et souple à utiliser...
- Suivez ensuite cette page d'aide à l'installation de la version console
Créez un pseudo de type [GPSPASSION]xxxxx
Et choisissez comme numéro de team : 51 (Team France)
Ces 2 points sont les plus importants pour pouvoir être rattaché à la mini-team => 51 pour appartenir à l'Alliance Francophone et [GPSPASSION] pour appartenir à notre mini-team)
Réglages : tapez "yes' pour accéder aux réglages avancés, ça permet notamment de moduler le pourcentage de CPU utilisé par le programme
- Paufinez l'installation en téléchargeant FAHTray (cacher la fenêtre DOS de F@H)
- Non obligatoire : Téléchargez Electron Microscope III : logiciel de surveillance du calcul de la WU en cours utile pour connaitre le détail de la proteine en cours et la fin théorique du calcul. Installer en suivant les instructions suivantes
- Alternative à EMIII : FAHMon : logiciel beaucoup plus simple à configurer et moins lourd en ressouces (c'est celui que j'utilise
 )
Et voilà, le tour est joué, vous êtes devenu plieur de l'équipe GPSPASSION ! 
Liens intéressants
Les membres de la Mini-Team GpsPasSion
TOTAL points = 7328 [+600]
TOTAL WU = 59 [+1]
(MAJ le 27/09/2005 à 13h45)
Team GpsPasSion
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gpspassion
93402 Posts |
Posted - 04 sept. 2005 : 00:37:41
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Client installé, mais CPU à 100%, il parait que ça se règle...vu et note rajoutée ci-dessus. Sinon pour arrêter la console DOS il suffit de la fermer en cliquant sur la croix.
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dop78
France
11 Posts |
Posted - 04 sept. 2005 : 08:33:22
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Ça y est, c'est installé sur mon PC.
J'aime beaucoup cette idée et surtout son utilisation qui, ici, a plus de chances d'aboutir à un résultat concret que seti@home...
dop -  |
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DocteurN
France
9591 Posts |
Posted - 04 sept. 2005 : 09:17:40
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Héhé, génial ! C'est quoi vos pseudos ?
A côté de l'intérêt premier qui est de lancer des calculs pour la Science sur son PC, il y a un existe un second challenge représenté par la lutte pour gagner des places au classement mondial à la fois au niveau de l'Alliance Francophone mais également de la Mini-Team GPSPASSION 
Vous pouvez trouver ces staistiques ici :
- http://folding.fleucorp.net/Alliance.htm
- http://www.alliancefrancophone.org/teamstats.html
Vous pourrez m'y apercevoir en 5135 position... bon aller ce n'est que le début
Il faut savoir que pour apparaître dans ce classement, il faut avoir terminé son premier calcul (=Work Unit = WU)
Concernant le CPU à 100%, cela ne devrait théoriquement pas poser de problème.
En fait le logiciel exploite le puissance CPU non utilisée de votre PC, et cela sans que l'utilisateur sente une quelconque gêne.
Un article intéressant sur l'impact de Folding@Home sur les performances du PC. Résultats : l'impact en tâche de fond est négligeable
Il est bien sûr possible en mode console de régler le % de CPU alloué à F@H soit à l'install initiale (comme expliqué ci-dessus) soit en lançant la console avec la commande "config" et en entrant dans les configurations avancées.
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fred et sylvie
148 Posts |
Posted - 04 sept. 2005 : 11:50:33
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Salut à tous,
je suis ce programme depuis 2 ans maintenant.
Sous XP, pour cacher la console, il suffit de la mettre en service pendant la configuration.
Cela lui permet d'etre invisible et de se lancer avant le log d'une cession de XP.
GPSPassion, il ne faut pas fermer la console par la croix rouge mais la fermer proprement par un CTRL+C sinon tu risque de perdre ton calcul en cours.
a+
Fred |
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DocteurN
France
9591 Posts |
Posted - 04 sept. 2005 : 11:54:12
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Oui effectivement il est possible de mettre en Service la console en utilisant Firedaemon mais le petit soft FAHTray est aussi très pratique et cela permet de rester maitre du lancement par exemple.
A noter : La méthode pour mettre en service se trouve ici : http://www.alliancefrancophone.org/inst_service.html
Sinon, Fred envit de rejoindre la mini-Team GPSPASSION ?
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gpspassion
93402 Posts |
Posted - 04 sept. 2005 : 12:00:08
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quote:
Originally posted by DocteurN
Concernant le CPU à 100%, cela ne devrait théoriquement pas poser de problème. En fait le logiciel exploite le puissance CPU non utilisée de votre PC, et cela sans que l'utilisateur sente une quelconque gêne.
Il est bien sûr possible en mode console de régler le % de CPU alloué à F@H soit à l'install initiale (comme expliqué ci-dessus) soit en lançant la console avec la commande "config" et en entrant dans les configurations avancées.
1. Oui, mais quand il passe à 100% ça se sent et surtout ca s'entend au niveau de la ventilation !
2. Comment lance t'on en mode config ? J'ai bien vu le réglage mémorisé dans .cfg mais comme ce n'est pas de l'ASCII je ne pense pas que ce soit directement éditable.
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fred et sylvie
148 Posts |
Posted - 04 sept. 2005 : 12:04:49
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DocteurN, la version 5.02 de la console permet une mise en service sans logiciel tiers : Voir >> ICI <<
Je te remercie pour ta propsition d'adhesion à ta miniteam :-), mais cela m'obligerai à changer de pseudo et donc à perdre le benefice de mes 262000 points et de ma 44 place au sein de l'alliance francophone.
a+
Fred |
Edited by - fred et sylvie on 04 sept. 2005 12:08:31 |
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fred et sylvie
148 Posts |
Posted - 04 sept. 2005 : 12:10:31
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GPSpassion, il suffit de lancer la console avec l'option -config dans les propriete de racoiuci qui te permet de lancer la console.
ensuite, tu choisis config avancée.
Note que tu pet faire entrée directement si tu ne modifie pas l'option.
a+
Fred |
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DocteurN
France
9591 Posts |
Posted - 04 sept. 2005 : 12:19:48
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Ah oui effectivement tu plies intensément... dommage  mais l'important c'est de participer au projet
La mise en service a quoi de plus de la version console + FAHTray ? Elle se lance automatiquement en fond au démarrage c'est ça ?
Team GpsPasSion
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fred et sylvie
148 Posts |
Posted - 04 sept. 2005 : 17:29:16
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oui, elle se lance, même si personne n'est loggué sur une cession windows.
cela permet de ne pas utiliser fahtray et d'utiliser fahmonitor, que je trouve plus sympas, pour une taille plus petite en mémoire.
a+
Fred |
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DocteurN
France
9591 Posts |
Posted - 04 sept. 2005 : 17:56:30
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Va falloir que je me penche sur cela alors...
Avec la version 5.02 de la console il suffit de lancer avec un raccourci contenant -service et appliquer cette procédure :
"-service
Exécuter le client en mode service (par exemple avec FireDaemon). Cela permet au client de ne pas s'arrêter lorsque l'utilisateur ferme sa session. Si cette option est utilisée alors que le client ne fonctionne pas en mode service, tout fonctionnera normalement, si ce n’est que le client ne se fermera pas automatiquement quand l'utilisateur courant fermera sa session, et une boite de dialogue "Wait for program to close." apparaîtra.
Si vous installez le client en service, vous êtes pour l'instant obligé d'éditer la base de registre pour spécifier les paramètres du client (la zone de texte de la gestion de services des outils d'administration n'est valable que pour le lancement suivant, les paramètres ne restent pas). Il faut donc lancer regedit, aller à cet endroit: HKEY_LOCAL_MACHINE\SYSTEM\CurrentControlSet\Services\FAH@D:+Folding@home+Client 5.00+FAH500.exe (le nom exact du service dépend du répertoire de votre client) et éditer la clef ImagePath pour y rajouter les flags qui vont bien. "
Rien d'autres à faire de plus ?
Team GpsPasSion
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djzero4
11 Posts |
Posted - 05 sept. 2005 : 14:46:54
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Rappel pour le CPU à 100% :
Je ne sais pas ce que vaux la config du pourcentage de cpu aloué, mais je sais que les WinNT (donc 2000 et XP) gerent tres bien les prioritées
Donc pour du SETI, Folding, encodage MP3/video et j'en passe (tout ce qui charge le CPU à 100%) il suffit de donné au processus une prioritée basse (trop peu de soft le font d'eux même) et tout devien transparent !
ceci est accessible dans la liste des process (ctrl alt suppr) et il ne faut pas tenir compte de l'avertissement de windows qui dis que ça peu affectée la stabilitée.
Avouez par exemple qu'il est préférable qu'un encodage video qui prend souvent 2h prenne 5 minutes de plus, mais passe "en second" par rapport a nos autres programmes lancés en même temps.
Bonne journée a tous, et pliez bien
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fred et sylvie
148 Posts |
Posted - 05 sept. 2005 : 17:19:55
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DocteurN, non, rien de plus si ce n'est qu'il n'est plus la peine d'utiliser Firedaemon.
Je confirme pour les flags (utilisateurs avancés.)
Djzero4, F@H est déja en priorité basse.
a+
Fred |
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DocteurN
France
9591 Posts |
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fred et sylvie
148 Posts |
Posted - 05 sept. 2005 : 19:05:13
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Salut DocteurN,
je viens d'en faire la demande à Athropos.
a+
Fred |
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